更始帝刘玄在李松、赵萌的迎接下，重新返回了长安。
赤眉军听到长安大乱的消息，便加速挺进的步伐，赤眉军到达了高陵后，王匡索性投降了赤眉军，并引导着赤眉军，向长安发起了进攻。
刘玄派李松出去迎战，但李松战败了，阵亡了两千多人，李松被赤眉军俘虏了。而李松的弟弟李泛，却正好是长安城守城的校尉，赤眉军押着李松进行要挟，李泛便立即打开了城门。
九月，赤眉军进入了长安。
更始帝刘玄一个人骑着马，匆匆地往城外逃去。他从厨门而出，许多妇女从后面追了上来，连声地大叫：“陛下你应当下马谢城。”更始帝刘玄便下了马，在地上拜了四拜，然后又骑上了马，一溜烟似地逃出了长安城。
当初，侍中刘恭因赤眉军拥立了其弟刘盆子为帝，就自缚到了监狱里请罪。现在听说更始帝出逃了，他便离开了监狱，步行追随更始帝到了高陵，在驿站里住了下来。
右辅都尉严东，怕放跑了更始帝以后，赤眉军会不放过他的，便率军驻扎在了驿站的外面，名义上是屯兵保护更始帝，而实际上却是看住了他。
赤眉军派人送来了劝降信说：“如果圣公肯投降，就可以封他为长沙王，但只限二十天，二十天过后这个承诺就无效了。”
更始帝刘玄便派了刘恭，去向赤眉军请降了。赤眉军派出了他们的高级将领谢禄，前往高陵接受了更始帝的投降。
十月，更始帝刘玄，随着谢禄赤着上身来到了长乐宫，将皇帝的玉玺献给了刘盆子。赤眉军的将领们，大声地怒骂着更始帝，并把他拖到了庭园中，准备要杀了他，但刘恭、谢禄都为更始帝说情，可赤眉军的那些个将领没有答应，还是把更始帝带走了。刘恭追了上去，大声地叫道：“我是极力护卫圣公的，就让我先死在圣公的面前吧?”他拔出了宝剑，打算自刎而死，这事感动了赤眉军的统帅樊崇，樊崇便下令放下了刘玄。
于是赤眉军便赦免了更始帝，并封他为畏威侯，但刘恭再次为更始帝求情，说赤眉军招降时说过要封刘玄为长沙王的。因为刘恭是刘盆子的大哥，因此赤眉军在无奈的情况下，便封了更始帝刘玄为长沙王了。
更始帝刘玄，一直便跟着谢禄，以便得到谢禄保护，而刘恭也寸步不离地保护着刘玄。
这时的赤眉军，军纪早已无比地败坏了，他们在长安城里大肆地烧杀抢掠，把京都三辅都置于水深火热之中了。老百姓反而都想念起更始帝刘玄了。因为刘玄当皇帝的时候，老百姓都还算是太平一些。张卯对此事深深地担忧，他对谢禄说：“现在各营的统军都想夺取圣公，将军一旦失去了圣公，大家就会合兵一起来攻打你，你、我就会自取灭亡了。”
于是，谢禄便派亲兵，与更始帝一起到了郊外去牧马，密令亲兵把刘玄缢死了。
刘恭得到了消息，连夜去为更始帝收了尸。
腊月初八，樊崇让刘盆子坐在了大殿上，由他主持了登基的大典，但是，赤眉军是一帮无组织的军痞，大家都带着武器上朝，也没人排座位，连贺表也没有人写。三三五五的、拉拉扯扯的，大司农杨音实在看不下去，于是便破口大骂：“一帮下贱的东西，今天君臣叙礼，竟搞得乱七八糟、形同儿戏，全部都该杀。”于是，众将在大殿上就打了起来，外面的卫兵也冲进来争抢酒肉，等禁卫军的军官带兵冲了进来，一连杀了一百多个人，才刚刚把场面控制了起来。
这刘盆子的登基大典，便也终于完成了。