李渊的大臣萧瑀和陈叔达说：“太子李建成与齐王李元吉本来就没有参与举义兵反抗隋朝的谋略，又没有为天下立下功劳。他们嫉妒秦王功劳大，威望高，便一起策划奸邪的阴谋。现在，秦王已经声讨并诛杀了他们，秦王功盖宇宙，天下归心，陛下如果能够决定立他为太子，将国家大事委托于他，就不会再生事端了。”
唐高祖李渊沉默了一会说：“秦王功勋磊磊，众望所归，当太子是最好的人选。”
李渊又心怀愧疚地对李世民抚慰道：“近些日子以来，我听信谗言，委屈了你，冤枉了你，请不要放在心里，大唐江山社稷还需要你来支撑啊！我把大唐江山交给你也是最放心的。”
李世民跪了下来，伏在父皇的胸前，号啕大哭良久。
事后，李世民宣布，叛逆的罪名只加给李建成和李元吉二人，对其余的党羽，一概不加追究。
当天，高祖颁布诏书大赦天下。唐高祖李渊下诏书立秦王李世民为皇太子，又颁布诏书：“从今天起，军dui和国家的各项事务，无论大小，全部委托太子处理和决定，然后再报告给朕。”
一个月后，唐高祖李渊将亲笔诏书赐给裴寂等人说：“朕应当加上太上皇的尊号。”表达了自己要退位和内禅的想法。并撤销了太子李世民兼任的天策上将府邸，为李世民登基做准备。
公元626年9月3日，唐高祖李渊颁布制书，将皇帝位传给太子李世民，自为太上皇，仍居于大内皇宫正殿——太极殿。李世民坚决推辞，唐高祖李渊不许。
高祖颁布传位制书的第二天，公元626年9月4日，太子李世民在东宫显德殿即皇帝位，是为唐太宗李世民，并大赦天下，从此开始了他辉煌的皇帝生涯。
李世民登基后以秦王府护军秦琼为左武卫大将军，又以程咬金为右武卫大将军，尉迟敬德为右武候大将军。以房玄龄为中书令，萧瑀为左仆射，长孙无忌为吏部尚书，杜如晦为兵部尚书。
李世民登基次月，亲率大军前往燕赵大地平乱。出发前，长孙无忌、房玄龄、杜如晦等谋士给李世民分析了为何燕赵大地会重新反唐的原因，一来是燕赵军战斗力不可小觑，还有另一个重要原因是唐朝对燕赵军的高压政策让他们不得不反，打输或者投降都是个死，干脆顽抗到底，所以即便是被唐.军打败逃走还能卷土重来。
所以，他们劝李世民这次去燕赵大地平叛不只单纯使用武力，而且要善待俘虏，安抚民心，这样燕赵大地才能最终平定、长治久安。
李世民觉得有道理，全部采纳。
李世民率领唐.军驻扎在燕赵大地卫州，刘黑闼多次派兵挑战，都被唐.军挫败。
刘黑闼害怕持久战不利自己部队，放弃相州，撤退到列人营设防守卫。这时洺水县的人要求当刘黑闼的内应，李世民派遣总管罗士信进城据守，刘黑闼又攻克洺水县城，罗士信寡不敌众阵亡，刘黑闼于是据守洺州。
李世民依仗洺水的险要，一字儿摆开军营来威逼刘黑闼，分别派遣秦琼、尉迟敬德等突袭部队，截断刘黑闼的运粮通道。
刘黑闼又多次挑战，李世民坚守壁垒不应战，来挫伤他的锐气。
刘黑闼城中的军粮已尽，李世民料定他必然要来决战，预先命人堵住洺水上游，对守堤的唐将说，战斗打响时，等刘黑闼军过河走到河中间就挖开堤坝。
刘黑闼果然率领步兵、骑兵两万人要过洺水摆阵，跟唐.军大战。
李世民一面率军和过河的刘黑闼部队厮杀，一面下令守堤的唐将挖开堤坝。
河水汹涌而来，刘黑闼部队溃不成军，被杀死一万多人，被淹死几千人。刘黑闼和红娘子带着残余的几千人溃逃而走。